24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1073 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  807    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  53.37 
 
 
438 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  47.34 
 
 
450 aa  358  8e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  44.75 
 
 
442 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  41.95 
 
 
437 aa  296  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  39.89 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  40.21 
 
 
446 aa  260  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  38.32 
 
 
438 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  35.19 
 
 
454 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  36.86 
 
 
384 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  37.36 
 
 
377 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  31.69 
 
 
439 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  28.68 
 
 
430 aa  139  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
405 aa  92.8  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  24.5 
 
 
419 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.83 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  22.6 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  22.64 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  24.94 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  27.08 
 
 
482 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  24.59 
 
 
437 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  22.52 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 
433 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>