82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3428 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  72.43 
 
 		 474 aa  670    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  70.74 
 
 		 472 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  70.74 
 
 		 472 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  71.37 
 
 		 471 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  67.81 
 
 		 491 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  70.74 
 
 		 472 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  72.21 
 
 		 495 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  73.26 
 
 		 476 aa  673    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  72.21 
 
 		 474 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  71.49 
 
 		 474 aa  673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  100 
 
 		 482 aa  978    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  30.24 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  32.86 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  28.3 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 531 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 504 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  26.42 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  21.56 
 
 		 468 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  23.87 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  20.51 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  33.33 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1355  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.676349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 424 aa  47.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 415 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 469 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 407 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  31.87 
 
 		 396 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  29.5 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  30.7 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 429 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>