31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2462 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  100 
 
 		 446 aa  855    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  62.25 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  43.82 
 
 		 438 aa  342  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  48.77 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  48.42 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  44 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 413 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  37.72 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  33.88 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  32.49 
 
 		 377 aa  153  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  36.03 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  24.85 
 
 		 402 aa  73.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  21.2 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  24.26 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 495 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  23.96 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  23.17 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  25.37 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  22.55 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.95 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>