18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22060 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  810    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  44.65 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  34.09 
 
 		 438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  36.99 
 
 		 437 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  30.83 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  33.5 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  31.89 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12237  integral membrane protein  27.81 
 
 		 512 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000931894  normal  0.428946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>