65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0984 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
391 aa  751    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  68.73 
 
 
405 aa  536  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  46.13 
 
 
419 aa  298  9e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  37.79 
 
 
441 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  30.71 
 
 
442 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
433 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  29.32 
 
 
431 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  25.2 
 
 
438 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  23.9 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  30.25 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  28.07 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  23.82 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  27.69 
 
 
442 aa  82.8  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  30.25 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  26.12 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  24.47 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  24.42 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  24.57 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 
476 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  26.18 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  27.49 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  24.26 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  26.79 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  25.06 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  26.16 
 
 
482 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  26.5 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  27.91 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  24.13 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  23.69 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  23.44 
 
 
474 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  27.91 
 
 
438 aa  67  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  20.83 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  25.62 
 
 
480 aa  63.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  26.91 
 
 
440 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  19.3 
 
 
446 aa  60.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  23.56 
 
 
471 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
531 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  23.31 
 
 
472 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 
472 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  23.5 
 
 
472 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
462 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  23.44 
 
 
454 aa  56.6  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  28.78 
 
 
430 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  23.14 
 
 
450 aa  53.1  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  24.42 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
402 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
446 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  24.05 
 
 
454 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.64 
 
 
470 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
513 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  23.88 
 
 
377 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  24.15 
 
 
468 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  20.97 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  28.7 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  28.07 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  28.07 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  25 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  27.16 
 
 
424 aa  42.7  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>