29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0364 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  875    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  74.15 
 
 		 442 aa  578  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  48.52 
 
 		 438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  53.67 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  51.14 
 
 		 442 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  47.34 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  41.58 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  40 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  35.95 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  35.25 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  36.36 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  20.78 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  19.9 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  27.71 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>