35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1979 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  800    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  32.31 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 440 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  22.08 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  21 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  19.77 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  21.75 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 446 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  18.93 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  20.43 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  22.36 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  26.16 
 
 		 377 aa  46.6  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  27.89 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>