80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0682 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  904    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  54.42 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 480 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  27.49 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 446 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 461 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.75 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 		 513 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  26.67 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 457 aa  93.2  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  23.8 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  24.42 
 
 		 468 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  21.44 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  23.06 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  21.9 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  22.07 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  21.22 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  23.14 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  20.21 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  19.46 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  25.28 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  21.72 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 407 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  21.33 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  19.18 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  24.76 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  31.86 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2452  hypothetical protein  23.2 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  21.26 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  23.71 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  20.47 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>