68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1005 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
446 aa  885    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
446 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.95 
 
 
504 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
457 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  25.73 
 
 
459 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  25.49 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
471 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
445 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
531 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  23.34 
 
 
468 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  27.11 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  24.92 
 
 
397 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  25.86 
 
 
480 aa  113  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  23.28 
 
 
470 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  27.46 
 
 
461 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  26.77 
 
 
461 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  25 
 
 
454 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  24.88 
 
 
450 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  27.48 
 
 
440 aa  99.8  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  25.29 
 
 
491 aa  97.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  25.95 
 
 
490 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
474 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
472 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  21.75 
 
 
469 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
474 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  24.05 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  26.17 
 
 
495 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  23.63 
 
 
472 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  23.63 
 
 
472 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  24.84 
 
 
444 aa  89.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  22.28 
 
 
476 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  23.88 
 
 
471 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  25.71 
 
 
474 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  23.14 
 
 
482 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  25.95 
 
 
482 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
402 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  21.48 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  22.3 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  25 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  21.76 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
433 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  22.46 
 
 
427 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  22.45 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  20.97 
 
 
405 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  17.87 
 
 
391 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  21.67 
 
 
420 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  19.55 
 
 
419 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  21.12 
 
 
430 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  21.07 
 
 
402 aa  47.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1529  major facilitator transporter  21.4 
 
 
394 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.324526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  26.45 
 
 
457 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  23.2 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  22.57 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  21.85 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  19.75 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  20.66 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  26.52 
 
 
460 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  26.03 
 
 
457 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  26.23 
 
 
457 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  22.59 
 
 
442 aa  43.5  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>