39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3317 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  836    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  89.41 
 
 		 427 aa  756    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  52.35 
 
 		 416 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 409 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  23.62 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  20.63 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 		 531 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  22 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  20.71 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  21.15 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  20.27 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 480 aa  43.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>