46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3435 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  835    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  80.14 
 
 		 434 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  24.66 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  20.91 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  31.37 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3821  major facilitator superfamily transporter  30.43 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.97 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  25.44 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  25.44 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  25.44 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  25.44 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  25.44 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  25.44 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 396 aa  43.5  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  22.22 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  22 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>