32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1143 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  100 
 
 
399 aa  755    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.41427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
359 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  39.69 
 
 
377 aa  129  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  25.85 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  29.47 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1639  major facilitator transporter  37.5 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.410094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  24.51 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  22.39 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  26.83 
 
 
428 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  27.56 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  29.92 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  24.48 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
438 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  27.2 
 
 
440 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 
398 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
415 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49514  predicted protein  28.93 
 
 
540 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  26.47 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  33.93 
 
 
409 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 
412 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  20.91 
 
 
447 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  23.9 
 
 
445 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 
449 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.57 
 
 
424 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  26.11 
 
 
434 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  26.95 
 
 
398 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  26.45 
 
 
391 aa  42.7  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>