51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3849 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  98.53 
 
 
407 aa  757    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
407 aa  763    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  96.08 
 
 
408 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  78.22 
 
 
411 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  61.65 
 
 
418 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  61.35 
 
 
410 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  55.33 
 
 
414 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  43.14 
 
 
397 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  39.31 
 
 
419 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  39.39 
 
 
418 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  41.54 
 
 
420 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  42.39 
 
 
399 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  40.45 
 
 
413 aa  222  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  41.21 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  34.94 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  40.66 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  39.6 
 
 
413 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  35.96 
 
 
366 aa  190  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  30.41 
 
 
439 aa  190  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  39.09 
 
 
418 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  39.09 
 
 
418 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  39.09 
 
 
418 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  39.09 
 
 
418 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  39.09 
 
 
418 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  39.59 
 
 
418 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  39.09 
 
 
418 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  38.89 
 
 
405 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
438 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  28.32 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  24.07 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  28.57 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  26.84 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  23.95 
 
 
377 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  26.11 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  21.34 
 
 
398 aa  53.5  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
412 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  28.03 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  29.01 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.27 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
421 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 
388 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  26.51 
 
 
385 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  28.22 
 
 
420 aa  46.6  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  28.11 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.93 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  22.69 
 
 
432 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  21.51 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  28.28 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  33.66 
 
 
393 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>