39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2780 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
421 aa  816    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  34.16 
 
 
434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  32.73 
 
 
435 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  28.02 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  29.97 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  30.71 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  28.19 
 
 
407 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  29.25 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  24.52 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
438 aa  63.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  29.17 
 
 
399 aa  60.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  27.91 
 
 
400 aa  60.5  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  32.06 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  25.71 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  29.67 
 
 
407 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  30.23 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  27.04 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.53 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
407 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  30.95 
 
 
418 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  28.07 
 
 
399 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  21.83 
 
 
398 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  25 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.79 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  32.67 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  23.25 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  24.62 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.15 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  36.47 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  29.59 
 
 
391 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>