51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0889 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 359 aa  696    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  25.8 
 
 		 432 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 396 aa  90.1  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1639  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.410094  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  25 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  19.36 
 
 		 447 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  23.21 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2069  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 473 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  21.35 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 420 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  20.8 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  20.25 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2367  major facilitator family transporter  23.66 
 
 		 473 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47374  predicted protein  26.83 
 
 		 557 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0618  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.8 
 
 		 424 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>