87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0925 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  782    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0644  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  20.76 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  20.79 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  21.21 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  28.86 
 
 		 459 aa  53.9  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  21.36 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  29.61 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2069  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  20.85 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  25.31 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  25.81 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  25.31 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  32.05 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  32.05 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  24.58 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 536 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.68 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.68 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.58 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.58 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.56 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07779  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 		 469 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.42969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  25.79 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.38 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  21.39 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  28.75 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  25.17 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  26.8 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  34.59 
 
 		 535 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  22.26 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26.44 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  26.15 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  22 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 509 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 433 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  26.97 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  26.89 
 
 		 480 aa  43.1  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 		 508 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04119  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 		 494 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0165  hypothetical protein  26.67 
 
 		 177 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>