29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0249 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  100 
 
 
428 aa  825    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
388 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  26.65 
 
 
432 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
447 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  30.09 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  29.38 
 
 
434 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  29.85 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  27.62 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  24.4 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1639  major facilitator transporter  30.55 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.410094  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  19.4 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
438 aa  57  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  26.83 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  22.49 
 
 
398 aa  50.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  25 
 
 
391 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  20.87 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  30.71 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  19.74 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25.82 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
420 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  24 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  25 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  27.01 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  25.6 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  23.97 
 
 
366 aa  43.1  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  27.88 
 
 
412 aa  43.1  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>