58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1379 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  858    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 398 aa  96.7  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  26.63 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 413 aa  90.5  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  21.2 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  20.13 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0423  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  24.19 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  24.19 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  22.67 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  21.05 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  17.77 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  29.29 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1639  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.410094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 416 aa  43.1  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 388 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>