27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20110 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 447 aa  896    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  30.89 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  20.38 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0618  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  24 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  19.36 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2069  major facilitator transporter  21.92 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  21.24 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  19.8 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2367  major facilitator family transporter  22.45 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  20.58 
 
 		 400 aa  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  20.87 
 
 		 384 aa  47.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1941  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.36 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01157  multidrug resistance membrane translocase  22.16 
 
 		 501 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1393  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.16 
 
 		 508 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230951  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  20.91 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 484 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>