174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1609 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  794    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  26.05 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  23.56 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3485  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  28.34 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.14 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  23.7 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.7 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  28.57 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.11 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  22.38 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.11 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.63 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.63 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.63 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 513 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  30 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1082  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.47 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 468 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.95 
 
 		 445 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 		 483 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  31.43 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  34.75 
 
 		 501 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  23.24 
 
 		 456 aa  47  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  27.01 
 
 		 467 aa  46.6  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  27.43 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  25 
 
 		 481 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  20.83 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 		 483 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  25.73 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.91 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  27.05 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  26.29 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  26.07 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  31.1 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  26.04 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  24.71 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  34.75 
 
 		 515 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  25.52 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  25.88 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  25.88 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.28 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  25.88 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.29 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  27.01 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  25.88 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>