106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1341 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  100 
 
 		 384 aa  743    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0644  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  24.09 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  20.3 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.57 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.27 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  21.64 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.59 
 
 		 526 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  21.29 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.4 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.18 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 		 513 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.8 
 
 		 527 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.8 
 
 		 527 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.17 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  24.6 
 
 		 534 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  26.04 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.06 
 
 		 508 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  25.41 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.76 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.53 
 
 		 512 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.37 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 493 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.92 
 
 		 507 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.92 
 
 		 507 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.92 
 
 		 507 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  30 
 
 		 468 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  25.34 
 
 		 424 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  25.66 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.91 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  27.06 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1472  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  25.34 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  26.37 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.43 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.78 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.73 
 
 		 532 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.7 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  21.87 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  27.42 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  27.42 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 478 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  23.98 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  27.42 
 
 		 418 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  23.98 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  27.42 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 478 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  33.82 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.98 
 
 		 479 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.98 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0325  hypothetical protein  22.63 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.53 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.39 
 
 		 512 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  30.7 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  23.44 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  23.44 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.1 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  25 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  27.42 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 470 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  34.38 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  27.1 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  23.94 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3045  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1322  major facilitator superfamily transporter  28.3 
 
 		 457 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>