68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0437 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  100 
 
 		 377 aa  727    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  25 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1639  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.410094  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  30.41 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  21.63 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  25.33 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.23 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.23 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  22.92 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.71 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49514  predicted protein  32.58 
 
 		 540 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.2 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.68 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.2 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1365  putative multidrug resistance-like efflux transmembrane protein  27.62 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  24.78 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  32.22 
 
 		 527 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.21 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 413 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2367  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 473 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.78 
 
 		 424 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>