37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0618 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0618  major facilitator transporter  100 
 
 
423 aa  833    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
447 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  23.11 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  22.13 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  22.13 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  22.55 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  21.86 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  26.39 
 
 
498 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  22.47 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  30 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0985  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 
501 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000298388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  20.65 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  22.28 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  30.17 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
402 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 
532 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  30.22 
 
 
467 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
435 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  21.53 
 
 
553 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  26.52 
 
 
500 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  21.53 
 
 
582 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  36.07 
 
 
1065 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  27.54 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.97 
 
 
480 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
524 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.44 
 
 
504 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.32 
 
 
480 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  21.47 
 
 
359 aa  43.5  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 
480 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  26.32 
 
 
480 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 
480 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 
483 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  22.99 
 
 
426 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  22.73 
 
 
418 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  26.32 
 
 
480 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>