62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2910 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  100 
 
 
432 aa  858    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
447 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  27.3 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  25.46 
 
 
434 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  24.32 
 
 
435 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  27.48 
 
 
389 aa  87  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  23.64 
 
 
377 aa  86.7  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  23.72 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  25.19 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1639  major facilitator transporter  25.25 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.410094  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  25.85 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0618  major facilitator transporter  23.11 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  22.54 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  22.85 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  22.46 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  20.79 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  21.79 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  23.26 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 
418 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2069  major facilitator transporter  21.34 
 
 
473 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0644  major facilitator transporter  24.22 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  23.81 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2367  major facilitator family transporter  23.28 
 
 
473 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  26.95 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  23.18 
 
 
366 aa  49.7  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  24.69 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  22.16 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  21.94 
 
 
430 aa  47  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  22.29 
 
 
384 aa  46.6  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  22.79 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.36 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.36 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
414 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  21.28 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  17.77 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47374  predicted protein  22.94 
 
 
557 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  30.68 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  21.76 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  22.64 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  23.11 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.82 
 
 
390 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  26.44 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 
424 aa  44.3  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.82 
 
 
390 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.63 
 
 
390 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  21.91 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.63 
 
 
390 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.63 
 
 
390 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  24.44 
 
 
433 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.63 
 
 
392 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>