37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2623 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 398 aa  763    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  46.26 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  26 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  22 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  22.12 
 
 		 366 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2906  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0739227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  22.08 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  21.32 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  20.9 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  20.9 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  29.32 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  24.5 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  28.24 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  23.28 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  20.92 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.21 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>