41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4313 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  763    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  85.75 
 
 		 406 aa  555  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  50.86 
 
 		 412 aa  342  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 435 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 388 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 421 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  23.48 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3282  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.27 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.7 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0162  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 485 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00020  maltose porter, putative  28.66 
 
 		 539 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0123203  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 451 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25.56 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  27.68 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 398 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 435 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>