56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3709 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  100 
 
 
408 aa  766    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  96.32 
 
 
407 aa  627  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  96.08 
 
 
407 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  78.02 
 
 
411 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  62.09 
 
 
410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  61.76 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  55.45 
 
 
414 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  43.32 
 
 
397 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  40.55 
 
 
419 aa  242  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  39.65 
 
 
418 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  42.75 
 
 
399 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 
420 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  40.81 
 
 
422 aa  220  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  40.55 
 
 
413 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  36.72 
 
 
468 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  41.77 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  39.25 
 
 
413 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  29.74 
 
 
439 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  35.77 
 
 
366 aa  192  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  38.5 
 
 
405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
438 aa  127  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  48.66 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  48.66 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  48.66 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  48.66 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  48.66 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  48.66 
 
 
418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  48.66 
 
 
418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  28.75 
 
 
391 aa  87  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  24.5 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  27.51 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  27.97 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0230105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  22.63 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  25.53 
 
 
398 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  26.3 
 
 
393 aa  53.5  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 
398 aa  53.5  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  23.63 
 
 
432 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  29.69 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.86 
 
 
416 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  27.07 
 
 
441 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  26.04 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.24 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  28.74 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.05 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  30.19 
 
 
516 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0423  major facilitator transporter  27.32 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0753  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  29.3 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
489 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
440 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>