39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0053 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  789    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  100 
 
 
418 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  99.76 
 
 
418 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  99.52 
 
 
418 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  789    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  74.87 
 
 
418 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  68.4 
 
 
413 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  69.38 
 
 
407 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  63.5 
 
 
413 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  64.11 
 
 
420 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  62.5 
 
 
422 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  57.11 
 
 
397 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  52.27 
 
 
419 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  56.62 
 
 
399 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  37.63 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 
418 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  38.89 
 
 
410 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  41.9 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
407 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  40.85 
 
 
408 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  34.19 
 
 
366 aa  171  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  38.52 
 
 
405 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  29.47 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  23.81 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  26.8 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  25.51 
 
 
391 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  20.25 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  30.25 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  29.58 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  27.42 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>