46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5608 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  763    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  57.62 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  57.8 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  54.71 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  58.7 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  55.95 
 
 		 420 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  56.1 
 
 		 413 aa  352  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  55.41 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  56.78 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  56.78 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 410 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 414 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 411 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 407 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  42.61 
 
 		 407 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  27.23 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  21.67 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  27.16 
 
 		 397 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 397 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  20.95 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30287  MFS family transporter: multidrug efflux  29.66 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  24 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  35.71 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2970  multidrug efflux system protein MdtE  30.3 
 
 		 466 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>