33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0952 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
381 aa  748    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  46.26 
 
 
398 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  31.35 
 
 
410 aa  176  5e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  32.02 
 
 
396 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  24.87 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  21.03 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  23.33 
 
 
410 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  21.02 
 
 
366 aa  56.6  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  30.69 
 
 
424 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  21.02 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  21.02 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  31.85 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  31.85 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  31.85 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  31.85 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  31.85 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  32.7 
 
 
424 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  24.14 
 
 
377 aa  47  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  30.32 
 
 
388 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  30.32 
 
 
388 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  32.08 
 
 
423 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  29.09 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  32.08 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  31.76 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  29.55 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  20.6 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  31.21 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  19.77 
 
 
389 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  22.58 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  21.89 
 
 
399 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  21.51 
 
 
407 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>