61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0736 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  100 
 
 
398 aa  762    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  27.18 
 
 
410 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  27.59 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  28.85 
 
 
377 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
359 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  26.34 
 
 
396 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 
381 aa  94.4  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  27.39 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  24.73 
 
 
366 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  25.69 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  26.4 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  25.57 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  22.79 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  26.02 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  22.34 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  26.58 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  25.37 
 
 
411 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  25.12 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  29.32 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  26.4 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  24.8 
 
 
413 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  24.63 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  20.77 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  22.49 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  20.95 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  20.95 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1639  major facilitator transporter  26.08 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.410094  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  20.5 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.53 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  19.15 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  24.82 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  24.82 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  24.82 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  24.82 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  24.82 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.44 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  22.36 
 
 
418 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.79 
 
 
418 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
406 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 
421 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.84 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.2 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.87 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.84 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  27.49 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  29.61 
 
 
530 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  26.06 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.62 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0423  major facilitator transporter  26.86 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  27.6 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  29.14 
 
 
411 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.19 
 
 
538 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
406 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>