60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0722 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  100 
 
 		 391 aa  739    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  45.18 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  25.79 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  27.61 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  24.04 
 
 		 432 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  19.61 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  24.39 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  28.93 
 
 		 491 aa  46.2  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  24.39 
 
 		 412 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  20.72 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  25.16 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2227  ABC transporter permease  26.21 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2393  ABC transporter permease  26.35 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0938241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.24 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  29.14 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  21.47 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  21.47 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  21.47 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2492  putative ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.214398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  21.47 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>