96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46289 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  100 
 
 
439 aa  891    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  36.78 
 
 
468 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  32.48 
 
 
414 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
418 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  31.4 
 
 
410 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  30.29 
 
 
411 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  29.74 
 
 
408 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
407 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  23.84 
 
 
366 aa  110  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  23.47 
 
 
419 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  23.49 
 
 
418 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  21.67 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  23.5 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  22.5 
 
 
413 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  22.25 
 
 
413 aa  87  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  26.2 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  23.01 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  23.01 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  23.01 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  23.01 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  23.01 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  22.78 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  23.01 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  23.01 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.02 
 
 
388 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.02 
 
 
388 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  22.08 
 
 
407 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  20.09 
 
 
438 aa  59.7  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.75 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 
423 aa  53.9  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
421 aa  53.5  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  24.88 
 
 
444 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  20.8 
 
 
359 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  30.07 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  24.16 
 
 
421 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  28.57 
 
 
421 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0368  major facilitator transporter  32.82 
 
 
416 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.37 
 
 
440 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  28.39 
 
 
404 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  28.39 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  24.35 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  23.23 
 
 
404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  22.69 
 
 
421 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.26 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  24.09 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
435 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  24.35 
 
 
426 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  24.35 
 
 
426 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  25.41 
 
 
576 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  23.14 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  29.66 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  32.98 
 
 
401 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  23.08 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  22.76 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  31.43 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.15 
 
 
409 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  27.59 
 
 
453 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.34 
 
 
493 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  24.78 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.07 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.56 
 
 
506 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  22.52 
 
 
408 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  22.94 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  22.27 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.47 
 
 
516 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.05 
 
 
399 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  28.57 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.07 
 
 
381 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  26.53 
 
 
376 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  23.33 
 
 
404 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.14 
 
 
447 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.36 
 
 
381 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
597 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  20.78 
 
 
406 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
399 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  23.31 
 
 
524 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
505 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  30.71 
 
 
425 aa  43.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  20.32 
 
 
404 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.58 
 
 
506 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  20.35 
 
 
410 aa  43.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>