38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2103 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  100 
 
 
422 aa  814    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  78.57 
 
 
413 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  61.85 
 
 
418 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  65.43 
 
 
420 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  64.09 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  62.13 
 
 
413 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  62.5 
 
 
418 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  62.5 
 
 
418 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  62.5 
 
 
418 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  62.5 
 
 
418 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  62.5 
 
 
418 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  55.67 
 
 
419 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  57.8 
 
 
397 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  62.5 
 
 
418 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  62.5 
 
 
418 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  55.15 
 
 
399 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  40.35 
 
 
414 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 
418 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  39.45 
 
 
410 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  43.22 
 
 
411 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  41.56 
 
 
408 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
407 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
407 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  34.97 
 
 
366 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  30.91 
 
 
468 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  36.5 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  22.78 
 
 
439 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  26.21 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 
398 aa  60.1  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  25.45 
 
 
391 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  22.93 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  28.89 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
359 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
421 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
388 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  24.37 
 
 
410 aa  43.1  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>