41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5228 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  764    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  73.09 
 
 
413 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  68.59 
 
 
418 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  62.53 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  64.09 
 
 
422 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  63.91 
 
 
420 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  69.38 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  69.38 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  69.38 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  69.38 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  69.38 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  69.63 
 
 
418 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  69.63 
 
 
418 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  58.7 
 
 
397 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  54.26 
 
 
419 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  55.15 
 
 
399 aa  319  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  41.46 
 
 
414 aa  250  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  42.68 
 
 
410 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 
418 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  42.78 
 
 
411 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  41.77 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 
407 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  33.8 
 
 
366 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  38.42 
 
 
405 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  29.86 
 
 
468 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
438 aa  86.3  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  27.99 
 
 
397 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
397 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  21.8 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  26.06 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  27.48 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 
359 aa  61.6  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  25.38 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  20.36 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  24.54 
 
 
396 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  24.58 
 
 
410 aa  47  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.39 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  24.56 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  26.89 
 
 
444 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>