51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1531 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  773    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 419 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  39.54 
 
 		 420 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 366 aa  169  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  41.74 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5142  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 413 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 397 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0081  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0064  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1491  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0064  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1208  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1561  light regulation of gametogenesis6 protein  37.73 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0053  hypothetical protein  37.73 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09393  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04000)  29.11 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.133031 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  26.74 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  28.87 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5620  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2460  macrolide-efflux protein  25.56 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2876  macrolide-efflux protein  25.56 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 504 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  38.33 
 
 		 450 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  41.54 
 
 		 456 aa  43.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>