32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1359 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  764    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  55.84 
 
 		 391 aa  388  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0423  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  28.78 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  26.15 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 510 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  27.17 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 521 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  23.81 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>