27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0514 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
391 aa  749    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  55.84 
 
 
393 aa  403  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  30.08 
 
 
398 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  26.62 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  26.19 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  24.67 
 
 
391 aa  67  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0423  major facilitator transporter  23.72 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  23.24 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  27 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  28.4 
 
 
384 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  25.73 
 
 
396 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  22.92 
 
 
428 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  30.25 
 
 
423 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  24.57 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  27.8 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 
458 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  25.38 
 
 
440 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1867  major facilitator transporter  24.54 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  25.19 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
479 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
521 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  32.46 
 
 
429 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>