154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1862 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  860    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  54.42 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 438 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  27.27 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  22.28 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  22.65 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  22.94 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  24.15 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 530 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  23.49 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  32.06 
 
 		 469 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.51 
 
 		 526 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  24.31 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  31.08 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.15 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  23.26 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  25.95 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 531 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.5 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  21 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 470 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2086  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 547 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.26 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 449 aa  47  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 		 519 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  27.22 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  27.22 
 
 		 387 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 447 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  27.22 
 
 		 387 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  27.22 
 
 		 387 aa  46.6  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  27.22 
 
 		 387 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  27.22 
 
 		 387 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.06 
 
 		 425 aa  46.6  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  27.22 
 
 		 387 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  27.22 
 
 		 387 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 519 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  29.51 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 		 521 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  29.2 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0399  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.12 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  26.58 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>