52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2056 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  825    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  28.03 
 
 
427 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  27.71 
 
 
427 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  24.87 
 
 
409 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.08 
 
 
504 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  25.12 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  22.73 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
462 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
531 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  24.5 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 
471 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  19.46 
 
 
454 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.03 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  20.78 
 
 
457 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
446 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.53 
 
 
480 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  21.21 
 
 
461 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  22.28 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  21.25 
 
 
491 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  22.27 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  23.17 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  22.17 
 
 
476 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  21.35 
 
 
474 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 
472 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  21.35 
 
 
474 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  22.03 
 
 
472 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  21.59 
 
 
471 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  22.39 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  19.89 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  20.23 
 
 
474 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  21.03 
 
 
495 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  21.39 
 
 
438 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  21.7 
 
 
422 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  20 
 
 
440 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  18.33 
 
 
468 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  19.78 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  20.46 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  19.58 
 
 
513 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  20.81 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 
427 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  21.62 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  21.96 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
406 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>