24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1312 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
418 aa  835    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  26.85 
 
 
408 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  28.61 
 
 
407 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  27.45 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  23.73 
 
 
440 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  24.67 
 
 
427 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  24.13 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  26.15 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  19.88 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.61 
 
 
488 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.15 
 
 
409 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  25.64 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  25.64 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  19.88 
 
 
461 aa  46.6  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  19.76 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  30.66 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  25.15 
 
 
420 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6654  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
452 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134718 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000423  multidrug resistance protein D  25.16 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.575568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.7 
 
 
409 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 
597 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.97 
 
 
558 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>