73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0421 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
433 aa  855    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  30.87 
 
 
438 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  30.6 
 
 
415 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  30.12 
 
 
415 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
420 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  30.62 
 
 
431 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  28.67 
 
 
441 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
421 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  30.36 
 
 
431 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  25.12 
 
 
437 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  27.95 
 
 
440 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  27.67 
 
 
440 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  26.94 
 
 
419 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
391 aa  96.7  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
406 aa  94.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  22.69 
 
 
406 aa  90.5  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  25.26 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  23.38 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  23.75 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
446 aa  67  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  24.15 
 
 
446 aa  63.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  23.92 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  21.47 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  22.44 
 
 
504 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  22.74 
 
 
408 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  20.06 
 
 
442 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  23.49 
 
 
461 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 
453 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  22.91 
 
 
413 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  21.03 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  22.29 
 
 
461 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
410 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  22.06 
 
 
468 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  21.84 
 
 
413 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  21.98 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  30 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  21.56 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  23.21 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.14 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
445 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  24.76 
 
 
401 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.37 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  24.88 
 
 
384 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  24.88 
 
 
384 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  24.88 
 
 
384 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  22.18 
 
 
531 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  21.82 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.88 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  29.61 
 
 
409 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.88 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  20.27 
 
 
495 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.88 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.88 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  20.94 
 
 
470 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  24.38 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  27.17 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  19.7 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 
462 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 
505 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  25.4 
 
 
400 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  21.11 
 
 
491 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  19.37 
 
 
474 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.38 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  28.42 
 
 
412 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 
513 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  21.28 
 
 
407 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.43 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  24.37 
 
 
390 aa  43.9  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  19.93 
 
 
474 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>