58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1339 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
471 aa  919    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  51.43 
 
 
513 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  50 
 
 
470 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  50.47 
 
 
468 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  52.17 
 
 
397 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  28.08 
 
 
504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
446 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  29.74 
 
 
461 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  29.82 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  29.48 
 
 
440 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  26.7 
 
 
444 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  27.36 
 
 
445 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  22.86 
 
 
454 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
457 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  24.59 
 
 
450 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 
446 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
472 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  25.49 
 
 
472 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 
531 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  24.54 
 
 
474 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  25.27 
 
 
472 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  24.02 
 
 
474 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  24.02 
 
 
474 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  25.26 
 
 
471 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  24.02 
 
 
495 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  24.66 
 
 
459 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
457 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  21.45 
 
 
480 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  27.68 
 
 
482 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  24.23 
 
 
476 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  24.32 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 
457 aa  87  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  25.58 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  24.43 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  25.55 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  21.51 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  23.49 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  25.69 
 
 
440 aa  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
402 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  26.32 
 
 
408 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  26.01 
 
 
440 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  20.37 
 
 
422 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  25.68 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  22.22 
 
 
490 aa  53.9  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  24.13 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  23.68 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  20.75 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  21.88 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  21.58 
 
 
430 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  20.83 
 
 
420 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.22 
 
 
551 aa  43.5  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  28.15 
 
 
432 aa  43.5  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>