75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5054 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 462 aa  929    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 		 531 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 453 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  26.56 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 474 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  26.56 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  25.2 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 480 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  27.27 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  26.4 
 
 		 397 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  21.62 
 
 		 468 aa  93.2  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 457 aa  90.9  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  25.56 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  23.51 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 457 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  27.75 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  28.9 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  19.52 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  25 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  21.22 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  27.8 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  27.8 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  27.8 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  27.8 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  27.8 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  27.8 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  27.8 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  27.8 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  27.8 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 409 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  27.31 
 
 		 423 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  27.31 
 
 		 423 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  27.31 
 
 		 423 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>