52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5604 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
457 aa  887    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  35.45 
 
 
490 aa  283  6.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  29.03 
 
 
461 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  28.88 
 
 
461 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  29.77 
 
 
440 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 
474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  28.78 
 
 
474 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  29.07 
 
 
495 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
472 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  28.89 
 
 
476 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  28.28 
 
 
472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  28.28 
 
 
471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  28.28 
 
 
472 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  28.2 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  27.67 
 
 
482 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  31.75 
 
 
482 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
471 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
445 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  28.57 
 
 
504 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 
446 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 
513 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  23.39 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  20.98 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  22.81 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  24.12 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  25.13 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  21.72 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
427 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  21.1 
 
 
480 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
462 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  26.64 
 
 
406 aa  60.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  20.47 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  21.99 
 
 
470 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  25.24 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  19.75 
 
 
450 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22 
 
 
469 aa  53.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  21 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  23.14 
 
 
438 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  32.74 
 
 
561 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  31.52 
 
 
530 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1220  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  27.43 
 
 
500 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  27.43 
 
 
500 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  27.43 
 
 
500 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  33.04 
 
 
513 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
418 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>