56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0357 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  89.41 
 
 		 474 aa  849    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  99.15 
 
 		 472 aa  944    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  98.94 
 
 		 472 aa  944    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  100 
 
 		 472 aa  951    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  98.94 
 
 		 471 aa  940    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  79.1 
 
 		 491 aa  745    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  89.38 
 
 		 495 aa  850    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  89.6 
 
 		 474 aa  854    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  89.81 
 
 		 474 aa  853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  82.02 
 
 		 476 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  70.74 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  30.48 
 
 		 461 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  31.51 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  27.27 
 
 		 490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25 
 
 		 504 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 471 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 446 aa  94  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  24.46 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 470 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  23.61 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  20.83 
 
 		 468 aa  63.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  19.61 
 
 		 457 aa  53.9  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 416 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 440 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>