75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2506 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  90.26 
 
 		 431 aa  677    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  835    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  60.19 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 415 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  22.74 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 440 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.89 
 
 		 615 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  31.25 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 530 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.37 
 
 		 528 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.83 
 
 		 621 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  22.54 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 474 aa  46.6  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1177  MFS permease  30.22 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 		 528 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  31.34 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  19.46 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2307  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.4 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  20.1 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 558 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.2 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.22 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2778  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 547 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.581095  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  29.71 
 
 		 515 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.2 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  21.74 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  28.37 
 
 		 501 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  21.89 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 495 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  21.89 
 
 		 474 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  21.89 
 
 		 474 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>