39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0024 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
406 aa  769    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  26.9 
 
 
438 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
433 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
420 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.29 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  23.84 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  21.68 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  23.47 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.7 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  26.5 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  24.81 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  24.23 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  20.92 
 
 
437 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  25.74 
 
 
413 aa  59.7  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  20.67 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  25.2 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  21.53 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
453 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.99 
 
 
480 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  23.87 
 
 
431 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  22.98 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 
457 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 
446 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  24.7 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  23.74 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  23.46 
 
 
440 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  21.57 
 
 
427 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  24.87 
 
 
459 aa  46.6  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  22.87 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  22.74 
 
 
459 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  26.24 
 
 
442 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  22.01 
 
 
491 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
385 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  23.66 
 
 
450 aa  43.1  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>