113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2748 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  90.26 
 
 		 431 aa  714    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  836    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  59.22 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 415 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  23.59 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 504 aa  57  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 483 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.2 
 
 		 621 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  29.03 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  28.03 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.14 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.67 
 
 		 530 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  23.73 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 474 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 		 569 aa  50.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 484 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 		 453 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 535 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.14 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 495 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.86 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 		 526 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 537 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.73 
 
 		 558 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1177  MFS permease  30 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  20.99 
 
 		 531 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  33.65 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 554 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  21.62 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0999  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.77003  normal  0.0952773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2307  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.84 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1525  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 519 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.8 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  29.7 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  29.5 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 702 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.23 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 		 737 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.56 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 510 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.97 
 
 		 505 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2304  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 535 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.66 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.05 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 502 aa  43.9  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.41 
 
 		 498 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  29.71 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 		 558 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.5 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  27.21 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  27.21 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.64 
 
 		 505 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 584 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>