14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2304 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2304  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  726    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0561  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1835  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1626  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0644  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.535291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1014  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1033  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.177021  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 394 aa  46.2  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  26.88 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0605  hypothetical protein  20.72 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  29.46 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>